В соответствии с Федеральным законом от 21.07.2014 № 238-ФЗ, о котором мы писали ранее, с 1 октября 2014 года налогоплательщик может не составлять счета-фактуры по соглашению с контрагентом-неплательщиком НДС, а также налогоплательщиком, освобожденным от уплаты НДС по ст. 145, 145.1 НК РФ (пп. 1 п. 3 ст. 169 НК РФ).
До настоящего момента не внесены соответствующие изменения в правила ведения книги продаж, утв. Постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 № 1137. Поэтому неясно, какие именно документы продавец должен регистрировать в книге продаж, если совершает облагаемые НДС операции, но при этом не выставляет счета-фактуры по соглашению с партнером.
Минфин России рекомендует в таком случае отражать в книге продаж реквизиты счета-фактуры, составленного в одном экземпляре, либо первичных учетных документов, подтверждающих совершение операции (см. письмо Минфина России от 09.10.2014 № 03-07-11/50894).